通常無菌室使用紫外燈時，為達到佳的消毒效果，要求紫外燈照射時間超過30分鐘以上，并且為保證操作者的人身健康，建議關閉紫外燈30分鐘后方可進入無菌室進行無菌操作。

依據消毒殺菌技術標準的指導，每一種微生物都有其特定紫外線殺滅、死亡劑量標準，其劑量是照射強度與照射時間的乘積【K(殺菌劑量)＝I(照射強度)t(照射時間)】。從公式得知，高強度短時間與低強度長時間之照射其效果是相同的。所以新紫外線燈開30分鐘可達到殺菌要求，但紫外線燈老化或有灰塵應適當延長殺菌時間。

紫外線對細菌有強大的殺傷力，對人體同樣有一定的傷害，人體易受傷的部位是眼睛之眼角膜，因此在任何時候都不可用眼睛直視點亮著的燈管，以免受傷，萬一必須要看時，應用普通玻璃(戴眼鏡)或透光塑料片，作為防護面罩。千萬勿錯用石英玻璃，因為普通玻璃對紫外線幾乎完全無法透過的。一旦受傷，不必驚慌，面部灼傷，幾天后表皮脫落，不藥而愈。眼睛受傷會紅腫、流淚、刺痛，約三、四天才能。不論如何，一遇到傷害，仍然建議立即至醫生處求診。